26 октября 1861 года Симбирская арестантская рота (нынешний Следственный изолятор № 1) была открыта по велению Императора Николая Павловича специально для производства работ в городе Симбирске. Численность арестантов на тот момент составляла 200 человек и все они должны были трудиться за пределами своих казарм. В отчете главного тюремного управления от 6 июня 1880-1882 годов перечисляются многие губернии, тюрьмы которых в те времена были переполнены более чем на 20%. Симбирская же тюрьма отмечена как «тюрьма с хорошими условиями содержания заключенных».

Из внутренних работ первое место занимало ткацкое производство, введенное с конца 1890 года. Данное направление деятельности было выбрано так верно, что впоследствии своими средствами в отделении установили еще 49 станков. Арестантское отделение занимало почти целый квартал на Сызранском выезде (ныне ул. 12 Сентября). Благодаря добросовестному отношению служащих тюремного ведомства России и Симбирской губернии в конце XIX-начале XX веков было принято много правовых документов, регламентирующих жизнедеятельность тюрем.

В 1983 году под руководством Никерова Н. Я. коллектив награжден переходящим Красным Знаменем. Введен в строй новый корпус для размещения спецконтингента, полностью перестроен хозяйственный двор, построено овощехранилище на 250 тонн, гаражи. Под руководством Грибовского Валерия Владимировича большое внимание уделялось благоустройству личного состава. Введены в эксплуатацию 5-этажный и 3-этажный дома по улице Куйбышева. С 2000 года, под руководством Портнова Василия Владимировича, следственный изолятор реконструируется как с внешней, так и с внутренней стороны, проведен ремонт камер спецконтингента, построено караульное помещение.

15 июня 1887 года в штаты тюрьмы были введены священники и дьяконы. Священники помогали тюремным служащим организовать первые библиотеки. На религиозные праздники священники приносили арестантам белый хлеб, свечи, масло для лампад. С 1913 года Исправительное арестантское отделение становится центральным местом для содержания граждан, которые арестовываются самыми различными ведомствами — от судов и Симбирского Совета рабочих, крестьянских, и солдатских депутатов до Президиума брандмейстера местной пожарной команды. Сюда сажают за спекуляцию, растрату и другие уголовные преступления.

До 1900-х годов состав осужденных, ссыльных и пересыльных состоял в основном из арестантов «простого» звания. В связи с нарастающими революционными идеями к началу 1900-х годов увеличилось число арестантов «привилегированного» сословия, в результате чего 21 марта 1906 года начальнику гарнизона г. Симбирска поступило распоряжение, Высочайше утвержденное 7 февраля 1906 года «Правилами о призыве войск для содействия гражданским властям», назначить военный караул в составе 18 человек в исправительное арестантское отделение, а также Губернскую Тюрьму. С 1913 года Исправительное арестантское отделение становится центральным местом для содержания граждан, которые арестовываются самыми различными ведомствами — от судов и Симбирского совета крестьянских, рабочих и солдатских депутатов до Президиума брандмейстера местной.

В 1920 году все места заключения передаются Центральному Карательному отделу при Симбирском губернском отделении юстиции. В 1934 году исправительный дом преобразован в Тюрьму № 1 управления НКВД города Ульяновска. К моменту начала Великой Отечественной войны тюрьма имеет 4 корпуса. 1 корпус для содержания больных заключенных на 8 общих палат. Корпус № 2 предназначен для пересыльных и женщин, корпус № 3 для содержания следственных по 58 статье (политических), 4 корпус для осужденных и следственных по бытовым статьям. В 1961 году, под руководством начальника учреждения тов. Серова Евгения Федоровича построен первый дом для сотрудников (нынешняя ул. Куйбышева).

В 80-ых годах ведется строительство свинарника на 60 голов на хозяйственном дворе учреждения. Коллектив вновь награжден в 1983 году переходящим Красным Знаменем. В это время введен в строй новый корпус для размещения спецконтингента, полностью перестроен хозяйственный двор, построено овощехранилище на 250 тонн, гаражи. С 1990 года большое внимание уделялось улучшению бытовых условий личного состава. Введены в эксплуатацию 5-тиэтажный и 3-х этажный жилые дома по улице Куйбышева. Работа по благоустройству следственного изолятора не прекращается. Проводится ремонт камер спецконтингента, построено караульное помещение.

В 2015 году в режимном корпусе № 2 в карцерных помещениях произошел пожар. Благодаря слаженным действиям коллектива удалось избежать больших потерь среди спецконтингента. Медалью МЧС России «За отвагу на пожаре» был награжден лейтенант внутренней службы Носов Алексей Николаевич. К 2016 году отремонтированы почти все внутренние помещения, закончена реконструкция здания с внешней стороны.

В 2018–2019 годах в учреждении создана постоянно действующая отдельная группа досмотра на КПП по пропуску людей на режимную территорию, оснащенная техническими средствами надзора, а также установлено автоматизированное рабочее место «Досмотровая группа» на КПП по пропуску автотранспорта.

В 2019 году для наблюдения за поведением подозреваемых, обвиняемых и осужденных оборудованы камерами видеонаблюдения прогулочные дворы, установлены видеокамеры в помещениях цехов столовой для обеспечения надзора за приготовлением пищи. Получена лицензия на право использования рентгеновской установки для досмотра грузов и ручной клади, установленной в комнате обыска подозреваемых, обвиняемых и осужденных.